Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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