Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms