Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms