Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PXDC1Q5TGL8 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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