Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms