Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms