Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM187BQ17R55 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms