Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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UBE3CQ15386 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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UBE3CQ15386 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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UBE3CQ15386 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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UBE3CQ15386 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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UBE3CQ15386 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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UBE3CQ15386 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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