Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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