Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAPQ14761 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms