Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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