Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms