Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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