Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms