Protein–RNA interactions for Protein: Q08881

ITK, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITKQ08881 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITKQ08881 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITKQ08881 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITKQ08881 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms