Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms