Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms