Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms