Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms