Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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