Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RPS29P62273 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RPS29P62273 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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