Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ESPL1-201ENST00000257934 6623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CACNA1C-205ENST00000399591 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CACNA1C-206ENST00000399595 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms