Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms