Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms