Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D1P54289 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms