Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms