Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRHRP34981 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRHRP34981 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRHRP34981 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRHRP34981 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRHRP34981 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRHRP34981 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRHRP34981 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRHRP34981 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms