Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms