Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms