Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB1P16220 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB1P16220 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB1P16220 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB1P16220 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB1P16220 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB1P16220 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms