Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms