Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHGAP10645 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHGAP10645 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms