Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX1O43812 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX1O43812 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms