Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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HOXA3O43365 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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HOXA3O43365 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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