Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms