Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3AO14802 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms