Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms