Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms