Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.1 ms