Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAI2Q9Y5P3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms