Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms