Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms