Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms