Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms