Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms