Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms