Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms