Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms