Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms