Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms